Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nae1Q8VBW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nae1Q8VBW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nae1Q8VBW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms