Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc58Q8R3Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc58Q8R3Q6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms