Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc12Q8R344 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc12Q8R344 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc12Q8R344 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms