Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf219Q8K2Y0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf219Q8K2Y0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf219Q8K2Y0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf219Q8K2Y0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf219Q8K2Y0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf219Q8K2Y0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf219Q8K2Y0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf219Q8K2Y0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf219Q8K2Y0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms