Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn3Q8K045 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn3Q8K045 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn3Q8K045 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkn3Q8K045 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms