Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SltmQ8CH25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SltmQ8CH25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SltmQ8CH25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SltmQ8CH25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SltmQ8CH25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms