Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Iffo1Q8BXL9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Iffo1Q8BXL9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Iffo1Q8BXL9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms