Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcfc2Q8BKT3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcfc2Q8BKT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms