Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best2Q8BGM5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best2Q8BGM5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best2Q8BGM5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms