Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim6Q8BGE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim6Q8BGE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim6Q8BGE7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim6Q8BGE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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