Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc38a9Q8BGD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a9Q8BGD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc38a9Q8BGD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc38a9Q8BGD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms