Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pknox2Q8BG99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pknox2Q8BG99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pknox2Q8BG99 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pknox2Q8BG99 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms