Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed4Q80WQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbed4Q80WQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed4Q80WQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed4Q80WQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms