Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmcc2Q80W04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmcc2Q80W04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc2Q80W04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms