Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc1Q80VQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc1Q80VQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc1Q80VQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc1Q80VQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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