Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh3b1Q80VQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh3b1Q80VQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms