Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnkQ7TSL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IfnkQ7TSL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IfnkQ7TSL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnkQ7TSL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms