Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnf1Q7TSH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnf1Q7TSH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnf1Q7TSH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms