Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PhkbQ7TSH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PhkbQ7TSH2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PhkbQ7TSH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PhkbQ7TSH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms