Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1bQ7TSF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg1bQ7TSF1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg1bQ7TSF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms