Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf139Q7TMV1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf139Q7TMV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf139Q7TMV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf139Q7TMV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms