Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox11Q7M6Y2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox11Q7M6Y2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox11Q7M6Y2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox11Q7M6Y2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms