Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl2Q78Y63 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcl2Q78Y63 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl2Q78Y63 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms