Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnt1Q6ZPR4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnt1Q6ZPR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnt1Q6ZPR4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnt1Q6ZPR4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnt1Q6ZPR4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnt1Q6ZPR4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnt1Q6ZPR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms