Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtifQ6PEE2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtifQ6PEE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtifQ6PEE2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtifQ6PEE2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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