Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim37Q6PCX9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim37Q6PCX9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim37Q6PCX9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim37Q6PCX9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim37Q6PCX9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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