Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retreg2Q6NS82 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retreg2Q6NS82 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retreg2Q6NS82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms