Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msl2Q69ZF8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msl2Q69ZF8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms