Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic2Q62520 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zic2Q62520 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zic2Q62520 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic2Q62520 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zic2Q62520 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zic2Q62520 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic2Q62520 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic2Q62520 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zic2Q62520 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic2Q62520 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zic2Q62520 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic2Q62520 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zic2Q62520 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic2Q62520 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic2Q62520 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic2Q62520 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zic2Q62520 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zic2Q62520 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zic2Q62520 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zic2Q62520 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zic2Q62520 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic2Q62520 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms