Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4bQ62179 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4bQ62179 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms