Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,77■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prm3Q62100 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Prm3Q62100 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prm3Q62100 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Prm3Q62100 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Prm3Q62100 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,6 ms