Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epha7Q61772 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha7Q61772 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epha7Q61772 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epha7Q61772 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms