Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsg101Q61187 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsg101Q61187 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsg101Q61187 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsg101Q61187 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms