Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa6Q5U901 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa6Q5U901 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpa6Q5U901 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms