Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata48Q5NC83 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata48Q5NC83 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata48Q5NC83 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata48Q5NC83 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms