Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
DroshaQ5HZJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DroshaQ5HZJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DroshaQ5HZJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
DroshaQ5HZJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
DroshaQ5HZJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DroshaQ5HZJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms