Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf3Q5HZG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf3Q5HZG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf3Q5HZG4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf3Q5HZG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf3Q5HZG4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf3Q5HZG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf3Q5HZG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf3Q5HZG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms