Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam228bQ497Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Fam228bQ497Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam228bQ497Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam228bQ497Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms