Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3V0E1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3V0E1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3V0E1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3V0E1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3V0E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3V0E1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3V0E1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3V0E1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3V0E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms