Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrfip1Q3UZ39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrfip1Q3UZ39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrfip1Q3UZ39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms