Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc160Q3UYG1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc160Q3UYG1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc160Q3UYG1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms