Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho2Q3UQN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcho2Q3UQN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcho2Q3UQN2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms