Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
D13Ertd608eQ3UPR8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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