Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Tmem253Q3UNB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Tmem253Q3UNB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Tmem253Q3UNB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Tmem253Q3UNB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Tmem253Q3UNB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
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