Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cobll1Q3UMF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cobll1Q3UMF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cobll1Q3UMF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms