Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Greb1Q3UHK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Greb1Q3UHK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Greb1Q3UHK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms