Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf3Q3UDR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yipf3Q3UDR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms