Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palb2Q3U0P1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Palb2Q3U0P1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Palb2Q3U0P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Palb2Q3U0P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms