Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms