Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a7Q3TXX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc17a7Q3TXX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a7Q3TXX4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms